病死率是确诊死亡人数与确诊病例的比值。根据国家刚刚颁布的《诊疗方案》，感染猪流感的以后情况与病毒分型有关，大部分分型预后情况良好。但目前数据显示，猪流感的死亡率高达6.77%，比一般流感要高。
　　高病死率的主要原因是，猪流感病毒作为一种新型病毒，人体完全没有免疫力，难以抵抗病毒攻击。不过，与禽流感和SARS（非典）相比，人感染甲型H1N1流感的死亡率并不高。最新消息显示，墨西哥首例确诊为猪流感的病例已经治愈出院。