统一后的税制大体上仍沿用旧的复税制，在全国开征的税种是从生产、销售、所得、财产等各个环节征收。这样，在征税过程中税种多、征收手续繁杂等问题没有得到根本解决。另外，统一后的税制对不同的纳税对象采取了不同的政策，例如，在《工商业税暂行条例》中规定：“公营企业应纳之工商业税，其属于所得额计算部分者，另按提取利润办法，缴解国库，不再征税”；“合作事业应纳之工商业税，其合于合作法之规定者，得酌于减免，征税办法另订之。”1950年3月3日和1950年9月6日通过的《公营企业缴纳工商业税暂行办法》和《清算一九五0年上半年合作社应纳工商税办法》中，还对国营和合作社经济作了一些特殊规定：“国营工商业总分支机构内部调拨货物不纳税；委托私营企业加工只就工缴收益按工业税率纳税，私营为国营企业代购代销产品，按实际所得的手续费征税；新成立的供销合作社免纳1年所得税，营业税按2%的税率征收，并打八折优待；新成立的手工业生产合作社免纳营业税和所得税3年，等等。”总体上看，这些政策有利于国营和合作社经济，却不利于私营工商业者；有利于工业，却不利于商业。  

经过三年的恢复和发展，国民经济取得了初步成就，工农业生产总值和国家财政收入也有了较大幅度的提高。然而，尽管工商税收收入的绝对额在这三年内有大幅度的增长，但在国家财政总收入中所占的比重却逐年下降。1950年工商税收收入为23.6亿元，占财政总收入的36.2%；1951年为47.5亿元，占财政总收入的35.7%；1952年为61.5亿元，只占财政总收入的33.5%。另外，1952年的税收也并不太顺利，只是勉强完成了六月份的调整计划(完成100.75％)，但占全国税收约70％的华东、中南、西南三区，则未完成计划，如再把各区寅吃卯粮(1952年l2月份的营业税、第四季度所得税及货物税的预征)及国营、合作社自查补报与罚没收入的数字减除，则总数也未完成(只能完成97％左右)。从税种上看，货物税、棉纱统销税、私营营业税、临商税和利息所得税，没有完成计划，其中货物税完成92.2％，私营营业税只完成82.4％。