第6版《传染病学》编写的主导思想与第五版基本上相同。既要努力适应21世纪社会进步和卫生事业发展的要求，服务于21世纪卫生技术人员在思想道德素质、身心素质、职业素质等方面的要求，体现三基（基础理论、基本知识、基本技能）、三特定（特定的对象、特定的要求、特定的限制）和五性（思想性、科学性、启发性、先进性、适用性）的精神，又要与《微生物学》、《免疫学》、《寄生虫学》、《流行病学》和《儿科学》有机衔接，防止脱节，避免不必要的重复，使全套教材形成完整的体系。为了与多数院校传染病学课程（上限为86学时）相适应，本版教材在不超过规定字数的前提下，新增加了下列题目：朊病毒感染（克雅病）、传染性非典型肺炎（SARS）、《突发公共卫生事件应急条例》。同时由于病毒性肝炎的病例数相对增多，该节的内容增加至4万字。由于抗菌药物的临床应用显得越来越重要，并与第四章内容关系密切，故从上一版的附录中移入第四章。
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