全书分成上编、中编、下编和附录四个部分。上编取名“传记篇”，是在南京大学教授朱庆华主持的中国科协“老科学家学术成长资料采集工程”项目——闵乃本项目组提交的结项报告基础上完成的。该篇通过对闵乃本的成长经历、学术贡献、国际合作、教书育人、社会影响等多方面的记录、梳理和再现，刻画了闵乃本是如何逐步从一个懵懂少年成长为我国晶体物理一代巨擘的诚朴雄伟的学术生涯。中编取名“述怀篇”，其中收录了五篇文章。第一篇是时任南京大学物理系党委书记张序余和九三学社纵光为书名《携手》（江苏人民出版社） 一书撰写的 “晶体世界的攀越者”一文; 第二篇、三篇则是闵先生自己发表于《人民日报》的两篇文章; 第四篇摘录于祝世宁为闵先生《晶体生长的物理基础》一书再版所写的序言;第五篇摘录于朱永元和祝世宁为《介电体超晶格》一书撰写的第九章“总结与展望”。从这一组文章中读者可以了解到闵乃本主要学术经历，学术成就及其影响，以及闵乃本自己对科学精神的理解。下编取名“追思篇”，由闵乃本的生前同事、好友、学生、亲属撰写的回忆文章组成，每位撰稿人从各自与闵先生交往的点点滴滴的深情回忆，展现了闵乃本崇高的科学精神、深厚的家国情怀和真诚的人格魅力。附录中有闵乃本代表论著目录、发明专利目录、获奖目录、参加国际学术交流目录、首次出国时以书信与家人交流方式书写的游记，以及闵乃本自己整理的英文简历（简历的最后几年因病没有收录完整）等部分组成。附录是闵乃本学术成长过程中相关史料的系统汇集，便于读者需要时查阅。
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