1953年，镇压反革命运动即将结束的时候，黄金荣携带进一步的坦白材料，在舟山同乡会会长陈翊庭的陪同下，来到外滩中央银行大楼军管会所在地，向上海市军事管制委员会主任粟裕和上海市副市长盛丕华递交了自白书，并详细交待了自己的历史罪恶。

然后，黄金荣与陈翊庭一道离去。但刚到楼下，陈翊庭发现自己有东西忘在办公室，便请黄金荣在门口稍等，自己去去便回。当陈翊庭取了东西来到楼下时，黄金荣却不见了踪影。一个86岁的高龄老人，在如此短暂的时间里能去哪里呢？

原来，黄金荣交代罪恶之后，唯恐罪大恶极，共产党或许不给宽待。倘若呆在军管会门口，说不定会马上被逮捕入狱。早年在淞沪护军使署的大牢里他已吃够了苦头，如若今朝再下大牢，定然会成为回不得家的孤魂野鬼，因而迫不及待地独自回到黄公馆。

交代罪行之后，黄金荣闭门不出，常常独自一人沉思冥想。由于整日处于惊恐焦虑之中，不久便发热病倒了，在病情日趋严重的日子里，黄金荣拒绝去医院就诊，他惟一的愿望就是在生活了半个世纪有着他大部分荣耀的钧培里黄公馆谢幕人生。

1953年6月20日，黄金荣停止了呼吸，终年85岁。

在上海滩“青帮三大亨”中，黄金荣年龄最长，发迹最早，却去世最晚。这个在中国半封建半殖民地的土壤中滋生出来的海上枭雄，在去世前做了忏悔，去世在他最钟爱的大上海，可以说是“寿终正寝”了。

黄金荣的去世，标志着一个以盗匪四起帮会横行为主要特征的时代，彻底终结。