第三类是抽分（特别商品税，工部征收），即对木料、竹子、麻、桐油、铁、煤、木炭、钉子、铜线等制造船只等交通工具所用的物品进行征税。收税站一般在北京、南京、淮安、正定、兰州、广宁、荆州、太平、芜湖、杭州等地。除了北京有四个收税站外，其他地区都是一个。

第四类是货物堆放许可税（门摊税，对货主征收）：货栈、货摊每三个月缴纳一次许可税，征收方式是由该地行业协会中的头面人物（会长）收缴后交给地方官。

随着商品经济的发展，明代税收机关人员、征收种类越来越多。每个收费站的工作人员多达上百名，如果加上相应的保安队伍，每个收费站的工作人员多达数百人。征税的品种，包括奢侈品（如丝织品、高级瓷器）、进口商品（香料等）、日常用品（草鞋、手绢、西瓜、大葱等我们今天常见的东西），多达两千种。对这些商品都作了细致的税收规定。例如：

药材每斤、白小碗每十五个，税钞、牙钱钞、塌房钞各二百文；荔枝、圆眼、冬笋、松子、桐油、柏油、黑砂糖、蜂蜜每斤，腊胭脂每两，土粉、土硝、硷、松香、墨煤、麻、肥皂末香槐花、胶枣、鸡头、螃蟹、蛤蜊每十斤，干兔、鸡、鸭每只，白茶盅每六个，甘蔗、藕每十根，竹箸每一百双，竹扫帚每十把，蒲席每领，杂毛小皮每张，毡、帽每个，草鞋每十双，税钞、牙钱钞、塌房钞各一百七十文。

明朝初期，朱元璋要求不对日常生活用品征税（丧葬用物及舟车丝帛之类免税，又蔬果饮食畜牧诸物免税），到了中后期几乎对所有东西都征税。很显然，税收对民众生活的负面影响很大。再加上明朝施行政府官员低薪制度，特别是吏役没有薪水，这种制度的负面作用比我们今天某些行业的“低底薪高提成”更甚。

由于税收的多少与吏役的收入挂钩，因此，他们在积极征税的同时，必然勒索克扣，甚至对一些战略物资强行征税。明政府不得不在1469年规定：对于执行政府任务的运粮、运物资的漕运军船不得征收船钞。起初，吏役们还不敢明目张胆地对漕粮等征税，只是对漕运粮船上的船员所带的自备粮草、燃料征税。但其后，随着吏治的腐败，吏役们的胆子也越来越大。

明政府对吏役们的所作所为并非没有察觉，也数次明文禁止这种行为，然而，基层政府的运作要靠他们，而他们不征税就没有收入来源，那他们的积极性从何而来？所以，最终还是老样子，役吏们仍然无法无天，商业税征收的地点越来越多，直到明朝灭亡。