（一）教育发展不均衡缺失公平

主要表现在地区之间、城乡之间、学校之间的办学条件和办学水平的差异很大，影响了基础教育发展的公平性和公正性。农村和边远地区教师数量不足，专业化程度不高，教育教学能力不适应素质教育需要。教师工资收入水平偏低，2006年全国中小学教师年均工资收入小学为17729元，中学为20979元，低于国家公务员较多，城乡差距依然较大。

（二）学校管理制度改革进展缓慢

中小学推进“三制度一管理”（校长负责制、教师聘任制、绩效工资制和教职工民主管理）改革，尽管有多年的历史，但进展缓慢，暴露出的一些深层次问题迟迟得不到解决。如“校长负责制”规定的校长的权力大打折扣，学校需要的教师不能由校长决定。党支部的保证监督职能很难落实，教职工参与学校管理十分有限，对校长的行为没有什么约束力。管理方式落后，多数学校以行政管理为主，依然是老样子，即使有点改革步子也不大，或“穿新鞋走老路”。

（三）应试教育倾向严重

中小学教育存在的老大难问题是应试教育太严重，学生的发展不全面。表现在：一是学生普遍缺少创新精神和实践能力，“两耳不闻窗外事，一心为了求升学”；二是课业负担过重，作业多，考试多，补课多，使学生失去了快乐的童年和少年；三是思想品德令人忧虑，不少学生不讲文明礼貌，只想自己，缺乏团结友爱精神，身心素质发展不健全。总的特点是学校为了生存而拼争，学生为了改变命运而苦学，家长为了孩子前途而忧心，有些政府部门为树立“政绩”而抓教育。从不同方面看，都聚焦在升学上。应试教育虽然不占主导地位，但升学考试在起指挥棒作用。一些教育行政部门或学校仍以升学率高低作为评价学校教学质量的唯一标准，这就加大了全面实施素质教育的难度。教育观念转变的缓慢和实行教育评价的落后进一步影响了整个教育的发展。