1861年，咸丰皇帝在热河去世，圆明园被英法联军烧毁。等到合约签订后，两位太后垂帘听政。恭亲王是议政大臣，他首先指定的政策，就是依靠外国军队平定内患。当时农民军占据长江流域，政府非常担忧，因此不惜借助外国军队，这不是很奇怪的事情吗？但这真是中国政府高明的地方，因为当时长江是通商地区，外国人明白这一点，因此英国、法国早就想出兵了。关于常胜军的历史就不再详细记述了。1862年，常胜军在江苏围剿农民军。1863年2月，英国政府允许戈登在中国带领常胜军，帮助戡乱。此后官军的声势大振，曾国藩得以平定战乱，使中国重新太平，戈登为清政府平定战乱做出了很大的贡献。1863年12月，苏州被收复，次年7月，南京被收复，洪秀全去世，战乱平定。一开始外国政府都主张中立，后来帮助清政府剿灭农民军，西方人不惜以生命的代价帮助清朝，这份情谊很重，就连法国的海军提督都在中国战死。

南京城被收复后，曾国藩上奏朝廷的奏折，以及朝廷的诏令，都不曾提到戈登的功劳。曾国藩在奏折中把功劳归于死去的咸丰帝，这是中国的传统，认为皇帝是神圣和无所不能的。这样的心理，不只在中国，日本也很明显。在战胜俄国之后，其将领把功劳归于天皇，和中国基本一致。在中国，凡是因为国家而死的人，政府给予的待遇，那是活着的人比不上的。如果外国人有功劳的，那更比不上了。曾国藩有勇有谋，但在这件事上态度的转变，让人感到薄情寡义。戈登将军虽然帮助平定战乱，但也随着英法联军攻入京城，烧毁圆明园，因此曾国藩不在奏折里提起他的功劳。

慈禧见到南京收复，心里很高兴，以皇帝的名义下达一道诏令，其抄录如下，可以看到她的性格，诏令中说：

此次洪逆倡乱粤西，于今十有五年。窃踞江宁，亦十二年。蹂躏十数省，沦陷数百城。卒能次第荡平，殄除元恶，该领兵大臣等栉风沐雨，艰苦备尝，允宜特沛殊恩，用酬劳绩。钦差大臣、协办大学士、两江总督曾国藩……筹策无遗，谋勇兼备，知人善任，调度得宜。曾国藩著加恩赏加太子太保衔、赐封一等侯爵，世袭罔替，并赏戴双眼花翎。浙江巡抚曾国荃……坚忍耐劳，公忠体国。曾国荃著赏加太子少保衔，赐封一等伯爵，并赏戴双眼花翎。