袁世凯自从受到多重恩惠，被频频委以各种职务之后，就知道自己没有能力做到全部兼顾，于是上疏请求辞去所兼的职务。疏呈上之后，圣谕说：

袁世凯奏，差务太繁，请酌开去各项兼差一折，前因庶务殷繁，以该督向来办事认真，特加倚任。先后派充商务、铁路、电政大臣，并会订商约、商律各事宜，及督修正阳门工程。兹据奏称，兼差太繁，力难兼顾，自属实情，除商约尚须续议，铁路时有交涉事件，均关重要，著毋庸开去。电政甫归官办，一切正资整顿，仍着该督督办。至商务、商律，现已设立商部，即着责成该部详议妥定。正阳门工程，著陈璧就近督修，俾该督于应办各事，专心经理，以示体恤。将此传谕知之。钦此。

袁世凯在接到圣谕之后，又上疏请辞：

窃臣云云……仰蒙宸训周详，嘉矜备至，跪聆之下，感悚万分。查商约、铁路、电政三项差使，既未蒙允开去，臣不敢以此烦渎宸聪，但臣近日体察情形，会办练兵一差，事宜繁重，更有非臣所能兼顾者，反复审计，深虞陨越，不得不沥陈于圣明之前。

伏维臣才庸识暗，资浅望轻，粗读父书，未谙韬略，渥蒙殊遇，谬领兼圻，顾分循渥，已难胜任。徒以遭时多故，受恩至深，明知弗克负荷，不敢意存规避，特过多功少，夙夜惭惶。乃者朝廷念时局之艰危，图自强之至计，特于京师设立练兵处，随时考查督练，以期各直省军制操法，悉归一律。仰见皇太后、皇上惩毖多难，锐意振兴，国势安危，在此一举。薄海钦仰，罔不振奋。而臣猥以驽下，奉命授为会办大臣，罔不殚竭血诚，勉思报称于万一。第思责任重大，才力实有所不胜，头绪纷繁，智虑不能遍及，事属创举，为向来所未有，则物情易骇，势处两难，欲认真整顿，则窒碍多端。疆臣本为统辖营伍之人，而练兵处实有纠查军政之责，以统辖与纠查而并诸一身，则又未免易启嫌疑。纵使悉泯偏私，一秉大公而任怨任劳，亦岂能尽如人意。毁誉之来，固不必计，措理之难，讵弗自知。况臣以北洋冲要，常居天津，既不能分身驻京，又不能专心经理。而兹事体大不容漠视，使因循以贻误，臣何以对朝廷；使粉饰以塞责，臣何以对清夜？臣非不知现在时势，为危急存亡之秋，整顿练兵，为固圉保邦之计，及今为之已嫌补牢之晚，受恩如臣，曷容卸责而不为。特无如称职甚难，求效匪易，糜躯原不足惜，复何以自安？即谓圣明在上，格外优容，而扪心内省，讵敢欺饰。臣并非矜辞让之小节，博谦退之美名，实因力薄材轻，责艰任巨，恐丝深毫无补，转令丛脞滋多，与其偾误于将来，曷若陈明于此日。合无吁恳天恩俞允，将臣会办练兵大臣一差开去，俾臣之事权稍轻，免臣之愆尤日集。是朝廷之保全臣者愈大，而臣之勉报朝廷者亦愈不敢宽，感戴慈施，永永无极。