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《想当厨子的生物学家是个好黑客》第11章(11)

想当厨子的生物学家是个好黑客 作者:(美)马库斯·乌尔森


对于人类这样已经将遗传图谱绘制出来的生物来讲,DNA测序仪能够根据已知的模式,自动把这些片段拼接起来,最后形成整个基因组的序列。但是,每个物种都有自己的基因组。已知的动物有100多万种,更不要说植物、真菌、细菌和其它单细胞生物了,所以需要进行基因组图谱绘制工作的物种数量是无穷无尽的。到目前为止,每一种首次进行全基因组测序的物种仍旧需要依靠人类的现有知识和灵感去搞明白该怎么把这些片段拼在一起。

麦考利白天的工作不仅仅是给那些尚未测序的物种进行测序工作。癌细胞也有自己的遗传特征。在麦考利与其同事把不同种类癌细胞的独特序列拼接起来的过程中,他们也将这些数据贡献给癌症基因组图谱计划(The Cancer Genome Atlas)。该计划是由联邦政府资助的联合项目,旨在深入了解遗传因素在疾病中扮演的角色。通过对比健康组织和癌变组织的DNA,他们希望能够提供信息给研究人员,让他们大概知道癌症出现时究竟是那些正常基因发生了突变。

麦考利不会将自己的工作带回家做,至少他在家里做的事情跟工作并不完全相同。回到家里,他感兴趣的工作会把他引到房子后面的车库中,在那里,他正开展一个自己的研究项目,他只称其为“独门秘方”。对于这个项目,他并不愿意多谈,因为像很多发明家一样,他相信他的工作会产生重大发现。他也如同硅谷的企业家一样,非常善于把自己的创意用华丽的词汇包装起来。

麦考利的雇主及其主要竞争者所制造的是用来阅读DNA序列的高端器材。这些设备的购买价格和使用成本高得惊人,至少对普通消费者如此。而在低端产品中,有一种叫做微阵列芯片(microarray)的产品,其中含有量身定做的化学物质,可以与特定序列的目标DNA结合,研究人员可以将微阵列芯片用作特定短链DNA的探针。麦考利察觉,这两种产品之间缺少一种中档产品,他希望自己可以填补这一空白。

麦考利希望他能在车库中将自己电子工程、计算机编程、生物信息学和纳米技术等相关背景结合起来,创造一种能随时随地解读DNA的电子装置。。与微阵列芯片不同,他的装置不需要依靠杂乱昂贵的化学物质完成这项工作。他的DNA探针将几乎完全依靠电子技术去识别特定的DNA样品。

“你能快捷、便宜、反复地完成对DNA的解读”麦考利说:“我已经能设想得到你用电场、DNA和传感装置完成这一简单明了的工作了。”


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