7月16日，中共二大在上海英租界南成都路辅德里625号召开，陈独秀、张国焘、蔡和森、李达、罗章龙、王尽美等12人代表全国195多位党员参会。

此次会议李大钊仍未参会，北京小组代表为张国焘与高君宇。陈独秀被推选为中共中央执行委员会委员长。大会明确提出反帝反封建的民主革命纲领，指明现阶段革命斗争的任务和方向，同时通过同国民党建立民主联合战线的决议案，至于以什么形式与国民党合作仍未作出决定。

此时马林去莫斯科寻求共产国际支持未归，陈独秀由于在社会上影响愈来愈大，法租界当局对此愈发紧张。二大召开不久，8月9日上午，巡捕房多名巡捕再次闯入陈独秀家中，将陈独秀带到卢家湾总巡捕房，并在陈宅搜出违禁书籍多种。

在这次营救陈独秀的活动中，其好友胡适出力甚大。胡适于8月16日得到陈独秀被捕的消息，立刻联络时任外交总长、哥伦比亚大学老校友顾维钧，称法国人近年做了很多伤害中国青年感情的事，他此次“并不是为独秀一个人的事乞援”，“一来为言论自由计，二来为中法两国国民间的感情计”，请顾维钧与法国公使沟通营救陈独秀。同时，还联络蔡元培到法使那里疏通。在各方努力下，8月18日陈独秀以罚款400元为代价，得以出狱。

然而，作为中共中央最高领导人，陈独秀每月只能从党组织领取很少的生活费，常常入不敷出，而此次出狱所花诉讼费等高达2000元，却是无论如何也筹不出的。

为此，陈独秀的好友蔡元培、李大钊、胡适、张国焘、蔡和森、邓中夏、刘仁静、高尚德、李石曾、蒋梦麟、林素园、范鸿勃、黄日葵、缪伯英等人，于9月24日在《晨报》上联名发表《为陈独秀君募集讼费启事》，缓解了陈独秀经济上的窘迫。

陈独秀与胡适，一向私交甚好，但在学术观点与政治主张上常常大相径庭，多次在报刊展开大辩论。此时胡适正在倡导“联省自治”、“好人政府”，陈独秀虽对胡适相救非常感激，但一出狱便在报纸上与胡适展开了激烈论战。