1946年年底，国民党在南京召开制宪国民大会，制定中华民国宪法，选举中华民国总统，中共及民盟等民主党派强烈反对和抵制，国共关系全面破裂。蒋介石一意孤行打内战，使美国政府大为不快，原来答应的美援大打折扣，最后干脆停止了军援。

陈诚在三人小组的言论及态度十分强硬，以至他看到马歇尔在“离华文告”中称“双方极端分子”的字眼时，怀疑自己就在其列。不过，眼看生灵即将涂炭，陈诚的内心也十分矛盾。

据杜伟回忆，大战在即，他曾劝陈诚去说服蒋介石停止内战，否则人民太痛苦了。陈诚说：“蒋只听马歇尔的，我不能阻止，即使讲了也是无益的。蒋已箭在弦上，不得不发。”杜说：“恐怕人家都会怀疑你在从旁推波助澜。”陈说：“我胃病很重，苦头还没吃透，看来还得再作恶几年才能了事。”

国防部长的职权是决定军事国防政策、指示方针。至于具体执行有关实施方案、军队的指挥与作战，则完全由参谋总长负责。按说参谋总长的职权就是指挥全国军队作战，但实际上，陈诚很多时候也只是替蒋介石打杂。蒋往往直接插手，指挥下面的军队。但作为参谋总长，陈诚对这场内战的发起，仍然负有不可推卸的责任。

按照美国的指挥程序，国防部和参谋总长都归总统直接领导，国防部长地位比参谋总长高，参谋总长负责军队指挥与作战，权力相当大。而当时国民政府实行的是五院制政体，国防部属行政院领导。蒋介石作为政府总统，不能直接指挥总参谋长。不过，他采劝变通”手法，将国防部、参谋总长、战略顾问委员会、保密局等都列为总统直接指挥单位，国防部部长有通过参谋总长对其下属部门间接指挥的权利。这样一来，陈诚的参谋总长实际上与国防部长平起平坐。

陈诚表面上十分推崇白崇禧，他公开表示：“国防部长有权，参谋总长有能。如无国防部之动员令及预算，参谋总长不能指挥一个兵，动用一文钱。”实际上，白崇禧几乎都被架空了。

1946年10月，在一次秘密军事会议上，蒋介石称要在“5个月内打垮共军”。而陈诚更是大放豪言，在回答记者问时宣称：“只要3个月就可以完全以军事解决问题。”

就1946年下半年和1946年春的军事形势而言，蒋介石确实掌握了一定的主动权。从6月进攻中原解放区开始，蒋军对解放区实施了全面进攻。人民解放军避其锋芒，以退为进。1946年春，在全面进攻收效不佳的情况下，蒋军又发动了对陕北和山东解放区的重点进攻。3月，胡宗南部占领了延安空城。蒋军的气焰达到了顶峰。

这段时期，陈诚几乎有三分之一的时间，都在各战地间往来奔走，传达指示，抚循士卒，策划部署。看一看他的行程路线图，就可知他的忙碌程度：