第二纪元就这样在一场毁灭性的大灾难中步向尾声，但还没有完全结束。大灾难有幸存者：忠贞派的领袖、英俊的埃兰迪尔（他的名字意为精灵之友），和他两个儿子伊熙尔杜和阿纳瑞安。埃兰迪尔是个诺亚一般的人物，他并未参与反叛，而是在努门诺尔的东岸附近安排了载着人手和物品的船只，在西方愤怒的毁灭风暴来临前逃离。给中洲西部带来了劫难的惊涛骇浪将他们席卷而去，他和他的子民被抛上海岸，成了流亡者。他们建立了两个努门诺尔人的王国，北边位于吉尔–加拉德的国度附近的是阿尔诺，南边远处位于安都因河口的是刚铎。索隆身为不朽者，堪堪逃过了努门诺尔的毁灭，回到魔多，经过一段时日后，他又强大起来，足以挑战努门诺尔的流亡者。

第二纪元以（精灵与人类的）最后联盟和大举围攻魔多的战斗告终。结局是索隆被推翻，邪恶化出的第二个可见的肉身形体被消灭。但胜利付出了代价，并且还犯了一个灾难性的大错。吉尔–加拉德和埃兰迪尔在消灭索隆的过程中双双殒命。埃兰迪尔的儿子伊熙尔杜从索隆手上斩下魔戒，索隆失去力量，魂魄遁入阴影消失。但邪恶开始运作。伊熙尔杜拒绝将魔戒丢入近在咫尺的地底火焰，而是把它据为己有，声称以它“抵偿父命”。他率军离去，却淹死在大河中，魔戒销声匿迹，没有任何人知道它的下落。但它未被销毁，依靠它的力量帮助建起的邪黑塔虽然空置，却未被毁，依然耸立。就这样，第二纪元随着高等精灵王权的断绝和努门诺尔人王国的来临，宣告结束。