元济深谙校书，以“书贵初刻”为选择底本之标准，千方百计地搜访一流善本，但又不拘泥于宋元旧椠，而是反复对勘，择善而从。遇有脱简残编或短篇缺页，总是设法配补齐全。一旦发现更早更好的版本，便不惜代价立即抽换。所以《百衲本二十四史》之所用，皆属一流上品，其中宋元15种，元本6种，明清初刻本3种，且多数是精心选取数个不同版本配补而成。上个世纪30年代曾追随元济先生校勘史籍的著名历史学家、山东大学教授王绍曾先生曾评价云：“是宋元以来全史善本的一次大集结，是宋元以后全史最佳集汇。”更难得者，乃元济先生在辑录过程中，逐步摸索出古籍整理相关门类的一整套学术规范。在前人校书经验的基础上，注重应用新兴科学校勘方式，从千头万绪的纷杂版本中，提纲挈领，理出版本源流，厘定文字得失，正确判定版本价值，以作为选择底本的依据；并将校勘与考证紧密结合，精密考订，择善而从。字字悉心校勘，页页精心修润，元济为《百衲本二十四史》所作《衲史校勘记》，便多达百数十册；且亲自监督印刷，用纸装帧精良。在这当中所总结出的基本规律和准则，至今仍被奉为古籍校勘的范例。

“百衲本”之印制，工序复杂；且每道工序从设置到操作，皆一丝不苟。为重现古籍原貌，印制时严格采用传统工艺精髓，以再现古典技法神韵。所用宣纸，为我国独创，有“纸寿千年”之说，为古籍藏书用纸首选，其质地坚韧柔软，着墨吸墨力强，印刷网点精细清晰，色泽洁白均匀。而印刷则采用向以“坚如玉，纹如犀”、“丰肌腻理，光泽如漆”而闻名于世的上乘徽墨，以保证印刷质量。此外，《百衲本二十四史》还运用传统石印技法，工艺古朴严谨，工序繁复，印制质量精细考究。并全部采用锦丝和牛胶等材料，进行手工古式装订，不易破散，坚韧结实耐久，便于翻阅，庄重典雅，尽显中国传统文化的神韵。

18个春秋，在历史长河中只能算是短短一瞬，但元济埋头修史之时，却正值国难当头的艰苦月。战火纷飞，政局动荡，校勘、辑印工作多次受到严重干扰。但有志者事竟成，《百衲本二十四史》终于在1937年隆重面世。它纠正了殿本三百年来造成的混乱，澄清了诸多长期困扰史学界的错误，历史功绩有目共睹，影响甚巨。三千卷皇皇巨制，亿万言字字心血，百衲本成为公认的最佳全本正史。对中国五千年文明史上有着总结性的珍贵价值，同时也是中国史学上的一座丰碑。如此耗尽了一代大师全部心血的文化工程，也成就了张元济古籍整理生涯的学术巅峰和作为出版业界泰山北斗的崇高地位。