地质微生物学

1 引言
参考文献
2 地球作为微生物的栖息地
2.1 地质构造的重要特征
2.2 生物圈
2.3 小结
参考文献
3 生物的起源和早期历史
3.1 起始
3.1.1 地球生命的起源一一泛生论
3.1.2 地球生命的起源一一重新出现
3.1.3 生命来源于水溶液中无生命的有机分子（有机汤理论）
3.1.4 表面代谢理论
3.1.5 生命起源于深海含硫的热熔液和含铁海水的交界处的单层硫泡沫中
3.2 前寒武纪生命的进化：生物和生物化学上的基准点
3.2.1 根据有机汤理论的进化理论
3.2.2 根据表面代谢理论的早期进化
3.3 证据
3.4 小结
参考文献
4 微生物的栖息地——岩石圈
4.1 岩石和矿石
4.2 矿物土壤
4.2.1 矿物土壤的起源
4.2.2 矿物土壤的结构特征
4.2.3 动物和植物对土壤进化的影响
4.2.4 微生物对土壤进化的影响
4.2.5 水对土壤的侵蚀作用
4.2.6 水在土壤进化中的影响
4.2.7 矿物土壤里的营养物
4.2.8 主要的土壤类型
4.2.9 微生物的类型及在矿物土壤中的分布
4.3 有机土壤
4.4 土壤表面下的情况
4.5 小结
参考文献
5 水圈作为微生物的栖息地
5.1 海洋
5.1.1 物理特性
5.1.2 海洋运动
5.1.3 海水的物理化学性质
5.1.4 海水和沉积物中的微生物分布
5.1.5 温度、液静压和盐度对微生物分布的影响
5.1.6 主要的浮游植物和浮游动物
5.1.7 浮游地质微生物
5.1.8 菌群
5.2 淡水湖
5.2.1 湖泊的某些物理和化学特性
5.2.2 湖底
5.2.3 肥沃的湖泊
5.2.4 湖泊演变
5.2.5 湖泊中的微生物量
5.3 河流
5.4 地下水
5.5 小结
参考文献
6 地质微生物作用过程：生理和生化概述
6.1 地质微生物作用体的类型
6.2 原核生物在地质微生物学上的生理学分类
6.3 在岩石圈、水圈无机物转化中微生物的角色
6.4 影响地质微生物学过程的微生物活动类型
6.5 微生物地质活动过程中作为催化剂的微生物
6.5.1 分解代谢反应——有氧呼吸
6.5.2 分解代谢反应——无氧呼吸
6.5.3 分解代谢反应——将不溶无机底物作为电子供体或受体的呼吸
6.5.4 分解代谢反应——发酵
6.5.5 发酵罐内进行的有氧呼吸、无氧呼吸分解代谢中能量是如何产生的
6.5.6 化能自养细菌（化能合成自养）产生还原力同化二氧化碳及合成有机碳
6.5.7 光能合成菌如何产生能量及还原力
6.5.8 合成代谢：高能键的能量捕获是怎样驱动能量消耗反应的
6.5.9 兼性厌氧、光合自养和异养微生物中碳的同化
6.6 有机质的微生物矿化作用
6.7 微生物新陈代谢的产物能够引起地质微生物转化
6.8 影响地质微生物活性的物理参数
6.9 小结
参考文献
……
7 地球微生物学非分子学方法
8 地质微生物学的分子生物学方法
9 碳酸盐的微物合成的降解
10 硅元素影响下的地质微生物相互作用
11 铝的地质微生物学：微生物与铝土矿
12 地质微生物与磷的相互作用
13 地质微生物与氮元素重要的相互作用
14 砷和锑的地质微生物学相互作用
15 汞的地质微笔学
16 铁的地质微生物学
17 锰的地质微生物学
18 铬、钼、钒、铀及钋的地质微生物的相互作用
19 硫的地质微生物学
20 地壳表面金属硫化物的生物合成和生物降解
21 硒和碲的地质微生物学特性
22 化石燃料的地质微生物学
参考文献