本书内容包含：棉花基因组调研与组装、棉花二倍体基因组研究、异源四倍体棉花基因组研究、棉花种质资源与变异组学研究、植物三维基因组学研究和棉花的表观遗传学研究。第一章介绍了基因组调研、测序技术、序列组装和基因注释相关的基础理论知识；第二章和第三章分别介绍了棉花二倍体和异源四倍体基因组研究的具体案例与科学发现；第四章主要概述了中国棉花种质资源的创新与利用现状，介绍了亚洲棉、陆地棉和海岛棉的变异组学研究进展，总结了重要农艺性状形成的关键位点和基因；第五章介绍了植物三维基因组学发展历程、主要技术、数据分析流程和**研究进展；最后一章介绍表观遗传基因组研究现状，总结了DNA甲基化、蛋白质翻译后修饰和非编码RNA研究成果以及棉花表观遗传研究进展。
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