真菌进化生物学

目录Contents
第一章 进化生物学概述 1
第一节 进化生物学与生物进化的定义 1
第二节 进化生物学的发展历程和主要理论 2
第三节 进化生物学的主要研究证据和研究方法 3
第四节 进化生物学的其他研究证据和研究方法 7
第五节 如何学习进化生物学 10
第二章 真菌物种的形成与多样性 13
第一节 真菌物种概念 13
第二节 物种的形成 16
第三节 物种形成隔离机制 20
第四节 真菌生物多样性 21
第三章 真菌分类系统与进化 30
第一节 真菌命名法规 30
第二节 真菌分类系统概述 36
第三节 极早期分化真菌分类系统与进化 39
第四节 壶菌分类系统与进化 42
第五节 接合菌分类系统与进化 45
第六节 担子菌分类系统与进化 51
第七节 子囊菌进化 63
第八节 类真菌菌物——茸鞭生物界菌物 68
第九节 类真菌菌物——原生生物界菌物 71
第四章 真菌形态建成与代谢的进化 81
第一节 单细胞向多细胞真菌的演化 81
第二节 菌丝体进化 85
第三节 真菌多态性 95
第四节 真菌的次级代谢进化与调控 104
第五章 真菌物种的遗传进化 116
第一节 自然选择 116
第二节 真菌的生殖及进化 121
第三节 真菌发育进化 133
第四节 真菌表观遗传调控与进化 141
第五节 真菌基因组的进化 151
第六节 真菌线粒体基因组进化 158
第六章 真菌种群的微进化 175
第一节 微进化 175
第二节 种群的遗传多态性 176
第三节 随机遗传进化 178
第四节 适应性进化 180
第五节 定向进化 184
第七章 真菌的协同进化 187
第一节 种间关系 187
第二节 协同进化 189
第三节 共生协同进化 196
第四节 寄生协同进化 207
第五节 捕食与竞争协同进化 215
第八章 真菌宏进化 220
第一节 宏进化的概念 220
第二节 进化速率与宏进化式样 221
第三节 宏进化趋势 227
第四节 宏进化的表现 229
第五节 灭绝 233
第六节 宏进化的实验研究 236
第九章 真菌分子进化的分析方法 240
第一节 系统发生树的基本概念 240
第二节 系统发生树的推断方法 241
第三节 系统发生树的统计检验 250
第四节 分歧时间估计及其理论基础 250
第五节 物种树和基因树 252
第六节 全基因组水平的系统发生树构建 253
第十章 真菌进化生物学应用 256
第一节 真菌次级代谢产物多样性与应用 256
第二节 驯化与育种 271
第三节 基因工程 278
第四节 合成生物学元件挖掘和底盘构建 283
第五节 从菌种选育到细胞工厂 290