陈独秀、胡适等人名气很大，张厚载的流言立即被上海等报刊转载，《神州日报》一时走俏。3月初，张厚载又在《神州日报》发表《半谷通信》说，"北京文科学长近有辞职之说，记者往访蔡校长，询以此事，蔡校长对于陈学长辞职一说，并无否认之表示"。

3月10日，胡适致函《北京大学日刊》说："两个星期以来，外面发生一种谣言，说文科学长及胡适等四人，被政府干涉，驱逐出校，并有逮捕的话，还说陈先生已逃至天津。这个谣言越传越远，竟由北京电传到上海各报，惹起了许多人的注意。这事乃是全无根据的谣言。"　　

谣言造到了蔡元培的头上，在陈独秀反击林纾、张厚载的同时，蔡元培也致函《神州日报》，对张文所言种种一一作了"否认之表示"。此时，张厚载从中牵线，《妖梦》正寄往《新申报》发排。后林纾觉得对蔡元培不妥，想撤稿，可是覆水难收。《妖梦》见报后，张厚载去信向蔡元培解释：

（林纾）近更有《妖梦》一篇攻击陈胡两先生，并有牵涉先生之处，稿发后而林先生来函谓先生已乞彼为刘应秋先生作序，《妖梦》当可勿登。但稿已寄至上海，殊难终止，不日即可登出。倘有渎犯先生之语，务乞先生归罪于生，先生大度包容，对于林先生游戏笔墨，当亦不甚介意也。

如此之攻击人身之作，岂可一句"游戏笔墨"即可轻轻开脱。蔡元培1919年3月19日复张厚载函，载同年3月21日《北京大学日刊》第338号，并附有张厚载致蔡元培函。蔡元培复信中并没有对《妖梦》发表之事耿耿于怀，而是针对张厚载造谣中伤北大教授：

得书，知林琴南君攻击本校教员之小说，均由兄转寄《新申报》。在兄与林君有师生之谊，宜爱护林君；兄为本校学生，宜爱护母校。林君作此等小说，意在毁坏本校名誉，兄徇林君之意而发布之，于兄爱护母校之心，安乎，否乎？仆生平不喜作谩骂语，轻薄语，以为受者无伤，而施者实为失德。林君詈仆，仆将哀矜之不暇。而又何憾焉！惟兄反诸爱护本师之心，安乎，否乎？往者不可追，望此后注意。

蔡元培时为北大校长，写给学生的信，执礼甚恭，称自己的学生为"兄"，言语谆谆，态度诚恳，可谓晓之以理动之以情。但蔡元培对有损北大声誉之举不会坐视不管。

3月31日《北京大学日刊》登出一则"本校布告"："学生张厚载屡次通信于京沪各报，传播无根据之谣言，损坏本校名誉，依大学规程第六章第四十六条第一项，令其退学。此布。"

当然，这个决议不是胡适个人决定的，也不是蔡元培个人决定的，是北大评议会做出的决定。周作人回忆说："当时蔡孑民的回信虽严厉而仍温和地加以警告，但是事情演变下去，似乎也不能那么默尔而歇，所以随后北大评议会终于议决开除他的学籍。"