冷战的结束并非意味着世界不稳定局势就此结束，美国人民很快对此便有所体会。正如国防部在1994年1月发布的年度报告中所指出的，美国在苏联垮台和世界军事两极对峙局面结束之后面临着四大安全挑战：

1. 核武器恐落入流氓国家或诸如恐怖分子等非国家危险人物之手，从而引发新的核扩散威胁；

2. 苏联势力在东欧及其他地区垮台之后，局部侵略行为恐接踵而至，加之长期敌对势力在中东、非洲次大陆和拉丁美洲继续存在；

3. 原苏联民主改革失败恐导致极权主义与扩张民族主义在俄罗斯卷土重来（这一点可能导致全球不少关键地区维持和平与稳定的合作受到削弱）；

4. 无论在短期之内，还是从长远来看，美国的经济困难恐削弱美国军事实力。

在战略核力量方面，美国、俄罗斯与其他三个境内拥有核武器设施的原苏联加盟共和国正按照第一轮和第三轮《削减战略武器条约》，将成千上万库存核武器予以销毁。到21世纪初期某阶段，美国将在三个基地部署500枚各自装有单弹头的“民兵Ⅲ”型地对地洲际弹道导弹，18艘分别配备24枚C-4或D-5导弹的“三叉戟”弹道导弹潜艇，48架载有高级巡航导弹的B-52H轰炸机和20架装备“无动力”自由下落炸弹的B-2隐形轰炸机。2010年之前预计不再有任何新的洲际弹道导弹研发项目。18艘俄亥俄级潜艇将被视为未来的主要核威慑力量。

在弹道导弹防御方面，美国在20世纪90年代不得不面对战区弹道导弹与核生化大规模杀伤性武器的威胁。随着核弹头或常规弹头技术的提高，进入90年代中期将有超过15个国家拥有弹道导弹能力，而且将有更多国家加入这一行列。因此，美国在90年代的一大挑战在于必须研究出更为有效的措施，通过提升现有反导能力或研发性能更好的新型系统来应对诸如此类的威胁。这些系统包括战区高空区域防御系统和“智慧眼”弹道导弹中段跟踪卫星等。

鉴于在原苏联，尤其是俄罗斯、乌克兰、白俄罗斯和哈萨克斯坦境内仍然存在数以万计的核武器，美国面临的一大问题在于这些核武器的保管与控制权很有可能易主，落入上述国家统治政府内部或外部人士之手。不仅如此，核部件、核材料和核知识有可能通过出口或其他途径从上述国家流入某些正在寻求建立自身核武库的国家。这些危险武器还有可能落入某些个人或组织手中，这些个人或组织素来我行我素，不经任何政府许可，企图利用核（生物或化学）恐怖主义达到自身目的。这一类核扩散威胁该如何控制？美国又该如何保护自身免遭这些大规模杀伤性武器的危害？美军正在大力开展研发工作，解决这些全新的可怕问题，同时通过“纳恩—卢格”计划向俄罗斯、白俄罗斯、乌克兰和哈萨克斯坦提供援助，帮助这些国家销毁其境内的核生化武器。