会后，何应钦会见了第二战区司令长官阎锡山。当时阎已接受中共抗日民族统一战线政策，出任牺牲救国同盟会会长。何应钦与之讨论了对日抗战的政略、战略、战术及苏联援华的可能性等问题。何应钦所主张的政略是抵抗日本之侵略。战略是实行持久战，放弃土地，无关重要。在持久战中，应研究减少敌人的飞机、战车、火炮三种力量的发挥。战术上，因敌军甚为骄傲，最好在敌骄慢之下，第一次会战须求得胜利，以正世界视听，尔后再将军队疏散，实行持久战。在具体的战术上，阎锡山则认为日军除运用火力外，他无所恃。其军官士兵生活优裕，感觉战争无意义。故在战斗上只要避开其火力，使其火力不能充分发扬，必可取得胜利。故宜在有利之地形与之作战，使其飞机、战车、火炮皆失作用。谈到苏联的援助时，阎认为非支持一年，不能得苏联之援助。何应钦不甚赞同阎锡山对日军士气的估计，而觉得日军在骄横之后，也有一股令人生畏的战争狂热。

正是出于对日军作战能力的过高估计，使何应钦对蒋介石的战略决策产生了消极影响。8月9日，蒋介石的德国总顾问法肯豪森视察华北前线后返回南京，便说：“我军如在一星期前采取攻势，必可将平津敌人歼灭，但目下再准备攻势，尚未为晚。”对于敌我双方的士气，法肯豪森认为，“敌方中级以上军官，愿意作战，下级官及士兵，则甚恐惧。我方适相反，士兵奋勇，高级官恐惧。”这些害了“恐日症”的高级官中，何应钦自然在内。

8月12日，国民政府在中山陵园举行会议，正式议决以军委会为抗战的最高统帅部，下设军令、军政、经济、政略、宣传、组训等部。何应钦仍为军政部长。同时又通过国民党中央政治会议与国防会议合并召开，改称国防最高会议的决议。

8月13日，日军进攻上海，企图一举攻占南京，以便南北配合，迫使中国政府屈服，实现三至六个月内灭亡中国的迷梦。国民政府被迫于14日发表了《自卫抗战声明书》，宣告：“中国决不放弃领土之任何部分，遇有侵略，惟有实行天赋之自卫权以应之。”对此，日本政府于8月17日公开声明放弃“不扩大方针”，把自七七事变开始的挑衅事件变成了名符其实的全面侵华战争。

从七七事变到“八一三”全面抗战，中国终于完成了从局部抗战到全面抗战的转变。何应钦也随之经历了自九一八事变以来的妥协、卖国、动摇、幻想，过渡到较积极地主张和实行抗战。但那个亲日、恐日、反共的幽灵始终没有离开他。